bioRxiv · Biophysics· Su, Z., Wu, Y. ·· 15 天前精选AI 评分59
多尺度动力学蒙特卡洛框架解析蛋白与小分子结合机制
Decoding the Physical Mechanisms of Protein-Small Molecule Association by Multiscale Kinetic Monte-Carlo Simulations
AI 导读
研究提出多尺度蒙特卡洛框架，将蛋白与小分子结合拆为分子相遇、进入口袋和有效结合三个阶段，用10个蛋白-配体复合物（覆盖9个靶点、实验结合速率跨越近四个数量级）进行评测。
推荐理由
该框架把蛋白与小分子结合拆成三个阶段并逐段扰动，为理解结合动力学瓶颈提供了可解释的计算参照。
来源：bioRxiv · Biophysics · biorxiv.org