bioRxiv · Pharmacology & Toxicology· Neema, P., Ozuguzel, U., Najafian, S., Chaudhuri, B. ·· 26 天前精选AI 评分58
基于结构的hERG姿态筛选流程：整合诱导契合对接、形状相似性、相互作用指纹与分子动力学
A Structure-Based hERG Pose Selection Workflow Integrating Induced-Fit Docking, Shape Similarity, Interaction Fingerprints, and Molecular Dynamics
AI 导读
研究提出并评估一套模板感知的hERG姿态筛选流程，以阿司咪唑、匹莫齐特和E4031结合的hERG结构作为实验参照环境，并以apo 8ZYN作为受体状态对照。诱导契合对接在自对接上优于刚性Glide，apo 8ZYN在短时分子动力学评估中未重现配体结合态行为；7个组内匹配体系中有6个满足双重MD质量判据，8个组间错配体系均未满足。
推荐理由
研究以配体结合态hERG冷冻电镜结构为参照，比较不同构象模板下的对接姿态筛选，为hERG建模的构象选择提供参照。
来源：bioRxiv · Pharmacology & Toxicology · biorxiv.org