bioRxiv · Bioinformatics· Huang, X., Tian, Z. ·· 21 天前精选AI 评分69
MIEN:面向蛋白口袋的糖链构象判别深度学习模型
MIEN: a deep-learning model for pocket-conditioned glycan pose and conformation discrimination
AI 导读
作者提出基于结构的等变图网络MIEN,用于评估糖链构象与固定蛋白口袋的匹配程度。模型在5241个实验复合物上训练,在260个蛋白不重叠的测试复合物上区分实验构象与非天然构象,并在AutoDock-GPU与GlycanDock候选池中更常选出低RMSD的top-1构象,使RMSD低于1、2、4埃的最佳构象数量增加。该结果为预印本摘要报告,仅涉及计算打分与对接候选筛选。
推荐理由
该预印本提出仅保留极性或CH-π接触原子的等变图网络,为糖链构象打分提供可迁移的界面建模思路。
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