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ChemRxiv Preprints· Haque, Imran S·· 13 小时前精选AI 评分63

ROSHAMBO3 开源发布:线性时间形状比对,较 ROSHAMBO2 提速 78–154 倍

Linear-time Shape Alignment with ROSHAMBO3

AI 导读

作者发布开源三维形状比对工具 ROSHAMBO3,通过查询摊销高斯场把内层循环变为线性,较此前开源 SOTA ROSHAMBO2 提速 78–154 倍。在 NVIDIA GPU 上筛选速度可达每秒 5500 万查询-构象对,并提供 x86、ARM CPU 与 Apple Metal 后端。该工具面向虚拟筛选与分子机器学习,代码已开源于 GitHub。

推荐理由

开源形状比对工具把内层循环从二次降为线性,为大规模虚拟筛选提供了可复用的加速实现。

来源:ChemRxiv Preprints · chemrxiv.org