Pranam Chatterjee· pranamanam·· 19 天前精选AI 评分58
Chatterjee 实验室发布 SNOOPPI 蛋白互作数据库，收录靶向与非靶向 PPI 数据
A single mutation or PTM can determine whether two proteins bind. But how can we predict binding specificity if our data lose those detai...
AI 导读
Pranam Chatterjee 团队发布 SNOOPPI，这是一个序列归一化的靶向与非靶向蛋白互作（PPI）数据库，论文已发表于 Bioinformatics。作者指出，单个突变或翻译后修饰（PTM）即可决定两个蛋白是否结合，而现有数据常丢失这些细节，因此该数据库面向结合特异性预测的数据需求构建。数据集已在 Hugging Face 开放，论文 DOI 为 10.1093/bioinformatics/btag736。
推荐理由
该数据库把蛋白互作数据中的序列细节与靶向和非靶向配对整理在一起，为结合特异性预测提供了可复用的数据基础。
来源：Pranam Chatterjee · x.com