bioRxiv · Biophysics· Jiang, P., Singharoy, A. ·· 3 天前精选AI 评分60
Biophysical Transformer：在序列与结构之外用连续生物物理场预训练蛋白质语言模型
Beyond Sequence and Structure: Pretraining PLMs on Continuous Biophysical Fields
AI 导读
作者提出 Biophysical Transformer，在序列和结构之外加入连续生物物理场作为第三种预训练信号，用 Poisson-Boltzmann 求解器计算每个三残基 token 周围的静电势，并以旋转不变球谐描述符作为损失目标，使推理时无需坐标。
推荐理由
该预印本把连续生物物理场作为蛋白质语言模型的第三预训练信号，并在热稳定性基准上给出与单序列对照的逐头比较。
来源：bioRxiv · Biophysics · biorxiv.org