bioRxiv · Bioinformatics· Sharma, Y. S., Subramaniyam, M., Passariello, P., Jay, D., Render, D., Szegedy, M. ·· 17 天前精选AI 评分60
研究：基因扰动基准的平均化掩盖扰动强度差异，影响模型评测
Averaging in gene perturbation benchmarks hides perturbation-strength variation: Consequences for model evaluation
AI 导读
该预印本研究考察基因扰动响应基准按扰动标签平均所有细胞的做法会丢失哪些扰动强度信息。作者用 X-Atlas/Orion CRISPRi 筛选，以深度校正后的 guide 丰度作为细胞层面扰动强度代理，发现扰动强度越高响应可重复性越好，该效应在 HCT116 和 HEK293T 两株人细胞系中均存在且在 HCT116 中更大。
推荐理由
研究指出扰动基准按标签平均会掩盖扰动强度差异，并据此检验现有模型能否保留这类信息。
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