AlphaFold3 伪系综可捕捉短淀粉样肽的 β 折叠组织与结构多样性

【摘要级】研究测试 AlphaFold3（AF3）模型集合（伪系综）能否预测短淀粉样肽的 β 折叠组织，在 117 条有明确偏好的肽中正确判定 112 条平行或反平行取向。对多态肽 MVGGVVIA 和 LYIQWL，同时采样两种组织可作为结构多样性的信号。作者指出，精确的 steric-zipper 结构建模可靠性较低且偏向紧凑构象，在共溶剂和金属离子存在下也无法再现溶剂介导界面或非经典配位几何。