RAPTORGraph：基于图的通路建模用于单细胞扰动因果发现

作者提出 RAPTORGraph，一种带 GraphPathway 编码器的 β-变分自编码器，用于在 Perturb-seq 类实验中建模基因间相互作用并做可识别的因果发现。模型通过预条件隔离被扰动基因的影响以消除干预溢出，并用最优传输对齐预处理数据，作者报告其在未见扰动的非加性相互作用分析上优于现有方法，在均方误差和最大均值差异等指标上表现相当。代码已开源于 GitHub，材料仅为预印本摘要。