研究用ProtT5嵌入构建蛋白结合位点网络，揭示跨尺度配体识别组织

研究将121,673个非冗余实验鉴定结合位点用ProtT5对配体接触残基的嵌入表示，并构建互最近邻网络。嵌入邻近性与局部结构相似性相关，网络整体呈现配体相关组织；中观尺度上，社区在既有蛋白分类内部显示异质景观，InterPro类别从紧凑邻域到分散识别环境不等。