bioRxiv · Bioinformatics· Shah, P., Panchali, R., Mody, P., Sanghvi, M., Narvekar, M., Karani, R. ·2026-11-11 08:00· 3 天前精选AI 评分65

一项审计研究：蛋白质语言模型的引导、激活与置信度读数能否被信任

The Confessions of a Protein Language Model: Steering, Activations, and What Predicted Confidence Cannot Certify

AI 导读

该预印本审计了已发表的重复序列引导、ESMFold 置信度和一种激活读数，检验这些干预与读数是否对应其预期目标。引导在操作点保持置信度，但在 alpha_50=1.240x 处出现拟合悬崖（扫描自身对照为 64.0%）；未引导的生成器激活可预测置信度门控（ROC-AUC 0.786±0.004）。

推荐理由

审计蛋白质生成筛选流程中重复引导、ESMFold 置信度与激活读数是否真正对应其目标，为设计筛选的读数选择提供参照。