用果蝇连接组做分子对接:MaleCNS 驱动刚性对接模拟
作者把雄性果蝇中枢神经系统连接组 MaleCNS(38,128 个神经元、300 万个突触)接入一个刚性对接模拟器,让果蝇“操控”星形孢菌素进入 CDK2(PDB 1AQ1)的结合口袋。仅训练边缘两层、约十万次强化学习后,果蝇从包括 9 Å 外且倒置的各个起始位置把分子对接到晶体构象 2 Å 以内。作者明确表示这并未解决药物发现,且模拟物理为自制、连接组本身未经训练。
作者把雄性果蝇中枢神经系统连接组 MaleCNS(38,128 个神经元、300 万个突触)接入一个刚性对接模拟器,让果蝇“操控”星形孢菌素进入 CDK2(PDB 1AQ1)的结合口袋。仅训练边缘两层、约十万次强化学习后,果蝇从包括 9 Å 外且倒置的各个起始位置把分子对接到晶体构象 2 Å 以内。作者明确表示这并未解决药物发现,且模拟物理为自制、连接组本身未经训练。