Edison Scientific 与普林斯顿合作发布 ChefNMR2,可从一维 NMR 谱自动解析小分子结构
Edison Scientific 与普林斯顿的 ZhongingAlong 合作推出 AI 系统 ChefNMR2,可从简单一维 NMR 谱自动完成小分子全新结构解析。
推荐理由:该模型用一维核磁谱自动解析小分子结构,并在五个基准上与通用大模型对比,可供关注谱图解析自动化的人参考。
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Sam Rodriques 发布 ChefNMR2,这是一个与普林斯顿 Ellen Zhong 合作训练的模型,可从 NMR 谱图推断分子结构,现已上线 Kosmos。在 2,031 个分子上,该模型 top-1 准确率为 82%,而单独使用 Claude Opus 5 为 52%。作者称这让天然产物结构推断更容易,从而减少药物发现中的一个瓶颈。
Rowan 发布若干更新以提升 FEP 计算精度,并推出新的配体参数化方法 Mango。作者称 Mango 在标准 8 体系 FEP+ 基准集上降低了能量误差,并提高了排序相关性指标。
推荐理由:Rowan 更新 FEP 计算流程并引入 Mango 配体参数化方法,给出其在标准 8 体系基准上的误差与排序相关性变化。
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Boltz于10月13日宣布,其小分子模型BoltzMol-1可直接搜索药明康德的GalaXi虚拟化合物库,该库规模约260亿个可合成分子,已在Boltz Lab平台和Boltz API上线供全球用户调用。
推荐理由:BoltzMol-1接入药明康德GalaXi化学空间,反映AI小分子模型对可合成化合物库的依赖。
insitro 与礼来合作构建的小分子体外及体内性质预测机器学习模型,现已向部分生物技术公司开放于 Lilly TuneLab。模型基于礼来数十年研究产生的多物种临床前数据训练,覆盖数十万个独特分子,并会随数据集扩展而更新;insitro 称其可作为当前从体外实验外推的行业标准方法的替代方案。
推荐理由:礼来与 insitro 用数十年多物种临床前数据训练的小分子体内 PK 预测模型进入 TuneLab,为早期筛选提供参照。
insitro 与礼来在 Lilly TuneLab 平台上线体内 PK 预测模型,可跨小鼠、大鼠、狗和猴四种临床前物种预测血浆清除率、稳态分布容积和平均驻留时间。
推荐理由:该模型用礼来历史数据直接预测体内PK,并与体外外推法对比,为小分子成药性评估提供参照。
Isomorphic Labs 的药物设计引擎 IsoDDE 可智能搜索庞大化学空间,设计面向真实世界的功能性分子,将过去数月的实验室工作缩短为计算数天完成。其药物设计智能体从生物靶点和目标分子性质等严格设计规范出发,在 2-4 天内自主迭代生成新分子设计,公司称带来真实世界功能性进展。
Inductive Bio 于 9 月 17 日发布 Beacon-2,该系统可直接从小分子化学结构预测人体有效剂量,先预测吸收、分布、代谢、排泄与毒性等决定剂量的性质并估算效力,再通过药代动力学机制模型整合。
推荐理由:Beacon-2 把人体有效剂量作为可从结构计算的指标,并给出在真实药物项目与公开化合物上的验证范围。
Inductive Bio 发布 Beacon-2,这是对 Beacon 系列模型的重大更新,可在 ADMET 之外直接从化学结构预测分子的有效人体剂量,由 ADMET-PK、效力与 PK/PD 三个可配置模块组成。
推荐理由:Beacon-2 把人体有效剂量作为可计算目标,并用 Indy 智能体的对照实验展示只优化效力会出现的偏差。
Valence Labs 构建了 Synflownet,用于生成最可能具有所需活性的可合成化合物,以提升活性分子搜索效率。该模型针对可购买分子数量达数十亿、无法逐一评估的问题,定位为“锁匠”式生成工具,而非逐个匹配的评估模型。
Ginkgo Datapoints、Tangible Scientific 与 Inductive Bio 联合推出 ADME-One,将完整的高通量 Tier 1 ADME 实验面板与 AI 驱动的人体 PK 预测及整合式化合物管理结合。三家机构称,该组合让团队可在命中化合物识别阶段就做出达到先导优化质量的决策。
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Marwin Segler 报告团队推出面向合成步骤生成的推理模型,针对该任务采用专门的思维链监督微调(SFT on COT)与可验证奖励强化学习(RLVR)。其表示语言模型在处理结构与丰富自然语言并存的化学任务(如合成)时带来新能力。
推荐理由:作者披露其合成路线生成推理模型采用SFT与RLVR训练,为化学语言模型的能力边界提供一手说明。