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10月10日周六
  1. AI药物设计实验室58

    Nature Communications|MALVINA:单细胞深度学习揭示细菌互作与药物如何重塑病原性

    《Nature Communications》在线发表的这项研究提出 MALVINA 工作流,将宿主—病原体共培养、高内涵成像与深度学习分类结合,分析 1320 个微孔、约 130 万个人结肠上皮细胞,同时读出细菌入侵宽度、入侵深度、感染细胞直接基因毒性和未感染细胞群体基因毒性四项指标。

    推荐理由:该研究把细菌入侵与宿主基因毒性拆成单细胞读数,为抗菌药物评价提供杀菌之外的观察维度。

6月3日周三
  1. Valence Labs 官网资讯60

    显微图像深度学习究竟学到了什么:Valence Labs 作者谈基准与可解释性

    Valence Labs @ Recursion 的 Ihab 在文章中讨论显微图像深度学习模型究竟学到了什么,指出在部分细胞培养显微任务中,多个已训练模型的表现与未训练网络和像素统计等简单基线相近,说明基准分数中有一部分信号并不需要高层生物学表征。

    推荐理由:作者结合自身基准测试经验,讨论显微图像模型何时学到真实生物学信号、何时依赖技术捷径,并提出可解释基线的设计思路。