Evaxion公布EVX-01二期新生物标志物数据，AI-Immunology平台预测与实际T细胞反应显著相关
Evaxion公布个体化癌症疫苗EVX-01在晚期黑色素瘤二期试验中的新生物标志物数据，直接ex vivo检测到EVX-01诱导的新抗原特异性T细胞，以CD4+ T细胞为主，半数患者观察到CD8+ T细胞反应。
推荐理由：该二期数据把AI新抗原预测与实际T细胞反应关联起来，为个体化癌症疫苗的靶点选择提供了临床层面的参照。
#多肽药物
Evaxion Biotech 官网资讯精选AI 评分6363
Molence精选AI 评分5858 Molence 发布 Mol-1 在 MolBench-Peptide-26 上的蛋白-肽预测结果
Molence 公布 Mol-1 在 MolBench-Peptide-26 蛋白-肽复合物预测基准上的成绩：DockQ > 0.23 为 88.8%，DockQ > 0.49 为 77.3%，DockQ > 0.80 为 54.1%。加入结合位点信息后，Mol-1-constraint 在相同阈值下分别提升至 92.2%、85.0% 和 60.2%。作者称生物位点信息在每个评测精度阈值上都改善了肽复合物预测。
推荐理由：Mol-1 在肽复合物预测上按 DockQ 阈值分层报告成绩，并对比加入结合位点约束后的变化。
下一分子精选AI 评分7474 分子之心MMDesign技术报告：19个设计项目18个获实验确认结合分子
分子之心在Zenodo发布扩展版MMDesign技术报告，覆盖18个靶点、19个设计项目，涉及VHH与大环肽两类模态，报告称18个项目获得实验确认的结合分子，项目成功率94.7%。
推荐理由：报告汇总19个设计项目的湿实验命中情况，并区分项目成功率与候选命中率，为评估生成-过滤-验证流程提供具体参照。
Evaxion Biotech 官网资讯精选AI 评分5858 Evaxion公布EVX-01二期试验三年随访数据：89%疫苗靶点诱导T细胞应答
Evaxion公布个体化癌症疫苗EVX-01在晚期黑色素瘤二期试验中的三年随访数据，全部患者均产生免疫应答，89%的疫苗新抗原靶点诱导出特异性T细胞应答。三年内T细胞应答的强度与广度得以维持，所有患者在两年随访时的临床缓解均保持，单用EVX-01治疗期间未见肿瘤进展。
推荐理由：该二期试验三年随访显示个体化新抗原疫苗的免疫应答与临床缓解得以维持，为AI靶点筛选提供了长期人体数据参照。
Google DeepMind / Isomorphic精选AI 评分6060 Google 推出 Antigravity 智能体工作台，用 ProtNLM 挖掘抗菌肽候选
Google 发布智能体科研工作台 Google Antigravity，并用它从 Streptococcus pseudopneumoniae 中找到一个预测对呼吸道感染病原体有活性的新型抗菌肽候选，该先导物正在接受湿实验验证。
推荐理由：展示智能体工作台如何把跨库检索、功能注释与结构查看串成一次会话，为抗菌肽早期发现提供可迁移流程。
Generate:Biomedicines精选AI 评分6868 Generate:Biomedicines 与 Zealand Pharma 合作开发肥胖及代谢疾病多特异性候选药物
Generate:Biomedicines 宣布与 Zealand Pharma 达成合作及许可协议，针对肥胖及其他代谢疾病设计多特异性候选药物，初始启动两个项目并保留第三个项目的选择权。公司称将先从患者所需的药物作用特征出发，再结合 Zealand Pharma 数十年数据与自身生成模型及高通量实验测量，设计具备目标生物学功能的多特异性候选药物。
推荐理由：该合作披露了双方在代谢疾病多特异性候选药物上的分工与初始项目数量，可了解生成式模型如何介入早期设计。
Evaxion Biotech 官网资讯精选AI 评分5858 Evaxion 新增 AI 设计现成胶质母细胞瘤疫苗 EVX-05，并终止 EVX-03 项目
Evaxion 于 8 月 17 日宣布扩展并调整研发管线，新增基于 AI-Immunology 平台设计的现成治疗性胶质母细胞瘤疫苗 EVX-05，靶向患者间共享的内源性逆转录病毒（ERV）来源抗原，同时终止 EVX-03 项目。
推荐理由：Evaxion 用 AI 平台识别 ERV 抗原，新增胶质母细胞瘤现成疫苗项目，同时停掉 EVX-03，呈现管线取舍逻辑。
Vilya, Inc.精选AI 评分6565 Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-2，可建模化学多样性分子界面
Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-2，称其无需模板或共进化输入，通过扩散和单一统一原子表示解析多肽与靶点复合物。公司称该模型对非经典多肽达到亚埃级精度，并准确预测 Zolucatetide、Daraxonrasib、Icotrokinra 和 Enlicitide 与各自治疗性蛋白靶点的相互作用。
推荐理由：Vilya-2 以统一原子表示建模多肽与靶点复合物，为现有工具难以处理的非经典化学体系提供参照。
LabGenius Therapeutics · News精选AI 评分7171 LabGenius与LG Chem达成多年研究合作、选择权及许可协议，用EVA平台设计肿瘤靶向多特异性抗体
LabGenius Therapeutics与LG Chem签署多年研究合作、选择权及许可协议，将用其AI/ML驱动的抗体发现平台EVA设计针对一种在多种难治癌症中表达的实体瘤抗原的肿瘤选择性多特异性抗体，目标是克服现有免疫疗法的脱靶毒性等局限。
推荐理由：协议披露了首付款、早期里程碑与选择权行权后的潜在里程碑结构，可对照同类抗体发现合作的分层设计。
MindWalk / ImmunoPrecise Antibodies精选AI 评分5858 MindWalk 公布登革热临床前数据，支持 HYFT 计算预测
MindWalk 公布登革热临床前数据，称基于 HYFT 预测靶点设计的免疫原在动物中诱导出针对全部四种登革热血清型抗原的交叉反应抗体，并在两次独立实验中重复。公司称 HYFT 在免疫前计算优先选出泛血清型靶点，打乱序列的对照未产生相应识别，CEO Jennifer Bath 称这是该疫苗平台上首次记录到从预测到结果的闭环。该结果属临床前结合层面证据，完整数据见公司新闻稿。
推荐理由：公司披露登革热免疫原在动物中诱导四血清型交叉反应抗体，并给出两次独立实验的对照结果。
1910 Genetics精选AI 评分6363 1910 Genetics在J. Med. Chem.发表PEGASUS：用大规模并行生物实验数据构建AI模型解析细胞穿透环肽极性
1910 Genetics在J. Med. Chem.发表题为PEGASUS的论文，介绍用基于大规模并行生物实验构建的AI模型解析细胞穿透环肽的极性。论文链接为https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.5c01836，具体模型性能与实验数据未在帖文中披露。
推荐理由：该论文介绍基于大规模并行生物实验数据构建的AI模型，用于理解细胞穿透环肽的极性规律。
Converge Bio 官网资讯精选AI 评分5858 Purple Biotech 与 Converge Bio 合作以生成式AI推进三特异性抗体平台
Purple Biotech 宣布与 Converge Bio 合作，利用后者的生成式AI平台设计和优化面向实体瘤的新一代三特异性抗体，以缩短发现周期并改善候选分子的可开发性。
推荐理由：合作把生成式AI用于三特异性抗体的设计与优化，可观察AI在抗体工程环节的具体分工。
Vilya, Inc.精选AI 评分7070 Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-1，用于大环结构预测与设计
Vilya 发布全原子基础模型 Vilya-1，专门建模含非天然氨基酸等多样化学的大环结构。公司称在公开与内部大环晶体结构合并基准上，Vilya-1 恢复晶体构象的表现超过次优方法一倍以上，物理与规则方法恢复的构象不到其一半，深度学习方法更落后。Vilya-1 还可微调用于富集可渗透化合物，并生成构象集合以评估能量景观、筛选结合剂；公司表示已在多个内部项目中应用该模型。
推荐理由：Vilya-1 以全原子模型覆盖非天然化学的大环结构预测，并给出与物理规则及深度学习方法的具体对比。
已经到底了