至知创新研究院发布分布式计算系统Tessera，在512张GPU上完成约3070万原子分子动力学计算
至知创新研究院在论文中提出分布式计算系统Tessera，基于E2Former V2架构的UBio-MolFM模型，在512张GPU上完成约3070万原子的完整能量与受力计算，单步耗时1.684秒，扩展效率89.7%。
推荐理由：该工作把多层等变机器学习力场扩展到数千万原子，并给出弱扩展效率与千万原子轨迹的结构统计对照。
#论文/预印本
机器之心 · AI4Science精选AI 评分6767
DrugAI精选AI 评分6868 浙江大学侯廷军团队发布PROTAC-DB 4.0，整合分子胶与XTAC并引入LLM问答
浙江大学侯廷军团队联合中国药科大学等在Nucleic Acids Research发表PROTAC-DB 4.0，将数据库从PROTAC扩展至分子胶和XTAC。
推荐理由：该论文把PROTAC、分子胶与XTAC数据整合进统一知识库，并给出LLM加RAG的检索架构，可作为靶向降解数据资源与AI建模的参照。
AI药物设计实验室精选AI 评分7373 上海人工智能实验室等提出 DrugHarness：亲和力比较准确率从 62.2% 升至 81.1%
上海人工智能实验室、中国药科大学等机构发布预印本 DrugHarness，将 80 多项科学工具的执行与带条件的技能学习整合到同一智能体系统中。加入冻结领域技能后，Qwen3.7-Max 在 MolBench 的亲和力比较准确率从 62.2% 升至 81.1%，优化成功率从 79.5% 升至 87.2%，但虚拟筛选 Hit@3 从 60% 降至 48%。
推荐理由：该预印本把智能体的工具执行与条件式技能学习结合，并给出基准与细胞实验的对照结果。
晶泰科技精选AI 评分6565 晶泰科技开源化学反应产率定量AI模型lcms2yield
晶泰科技在GitHub开源化学反应产率定量AI模型lcms2yield，同步开放模型权重、推理代码及训练与评测数据集。
推荐理由：晶泰科技开源可预测紫外校正因子的模型，为高通量实验的产率定量提供了可复现的替代路径。
Mol.AI精选AI 评分6363 浙江大学团队在Nature Communications发表CycloPepper，用机器学习预测环肽环化位点并上线在线工具
浙江大学李承熙团队在《Nature Communications》发表CycloPepper，用机器学习预测治疗性环肽的环化结果并优化合成。研究基于全自动环肽合成平台CycloBot构建306个环肽数据集，采用SVC模型结合One-hot编码、氨基酸组成、二肽组成及16维理化特征，交叉验证准确率84%，实验验证一致性86%。
推荐理由：该研究用自动化合成数据训练环化位点预测模型，为环肽合成路线选择提供了可复用的在线工具。
David Mobley精选AI 评分5858 David Mobley 团队发布预印本：用扭转态跃迁计数检测蛋白-配体模拟采样问题
David Mobley 团队发布新预印本，介绍一种用于发现蛋白-配体复合物常见模拟中采样问题的简单分析工具，其做法是统计扭转态之间的跃迁次数。作者称该方法简单但出乎意料地有用，预印本已发布于 ChemRxiv。
推荐理由：作者发布预印本，介绍一种通过统计扭转态跃迁来识别蛋白-配体复合物模拟采样问题的简单分析工具。
Eikon Therapeutics 官网资讯精选AI 评分5858 Eikon Therapeutics 在 Nature Methods 发表斜线扫描（OLS）技术论文
Eikon Therapeutics 在 Nature Methods 发表论文，介绍其斜线扫描（OLS）技术，该技术可与公司单分子追踪（SMT）平台结合，在活细胞中以最高每秒 14 平方微米的速度评估蛋白运动。
推荐理由：Eikon 在 Nature Methods 披露 OLS 与单分子追踪平台的技术细节，为高通量蛋白动态测量提供方法参照。
已经到底了