浙江大学侯廷军团队发布PROTAC-DB 4.0,整合分子胶与XTAC并引入LLM问答
浙江大学侯廷军团队联合中国药科大学等在Nucleic Acids Research发表PROTAC-DB 4.0,将数据库从PROTAC扩展至分子胶和XTAC。
推荐理由:该论文把PROTAC、分子胶与XTAC数据整合进统一知识库,并给出LLM加RAG的检索架构,可作为靶向降解数据资源与AI建模的参照。
浙江大学侯廷军团队联合中国药科大学等在Nucleic Acids Research发表PROTAC-DB 4.0,将数据库从PROTAC扩展至分子胶和XTAC。
推荐理由:该论文把PROTAC、分子胶与XTAC数据整合进统一知识库,并给出LLM加RAG的检索架构,可作为靶向降解数据资源与AI建模的参照。
Google DeepMind 为 Google Antigravity 发布 Cheminformatics Skills,基于 RDKit 并接入 ChEMBL 与 PubChem,让语言模型负责流程编排、确定性化学工具执行分子计算。
推荐理由:官方演示了智能体在真实肺癌药物数据上完成检索、配对分析与大环设计,可观察化学工作流的自动化边界。
Corin Wagen 表示,自动生成合成中间体是 Rowan 已加入的体验改进之一,与自动扭转角重拟合、收敛检测等功能并列。他引用的 @manntis4 内容称,在测试小分子辅因子支持 FEP 时发现,把合成中间体配体加入 RBFE 图可改善与实验结合亲和力的相关性,示例为 KRAS-G12D。Wagen 认为稳健的智能体驱动 FEP 还需要更多此类能力。
推荐理由:Rowan 团队以 KRAS-G12D 为例说明合成中间体配体如何改善 RBFE 与实验亲和力的相关性,并列出自动化改进方向。
在Roche Pharma Day 2026演讲中,Aviv Regev介绍罗氏正在建设的Lab-in-the-Loop,将AI、基础模型、自动化实验与临床数据嵌入从靶点发现到临床验证的环节;2025年第四季度至2026年第二季度约40%的研发管线决策存在可追踪的AI或计算贡献。
推荐理由:罗氏披露AI在研发管线决策中的实际占比与闭环建设路径,为评估药企AI落地程度提供参照。
Inductive Bio 发布 AI 化学助手 Indy,面向其合作项目开放,公司称已在内部合作项目中使团队产能翻倍。Indy 可解析 CRO 报告、QC 剂量响应曲线、分析历史 SAR、运行生成化学算法、搭建 FEP 计算并生成项目汇报幻灯片,并接入 Inductive 的 ADMET 与 PK 模型。
推荐理由:Indy 在真实剂量响应曲线上的准确率对比通用大模型,展示了药化专用助手与通用模型的差距。
Inductive Bio 发布小分子药化助手 Indy,内嵌于其 Compass 平台,可做剂量响应数据质控、FEP 提交、人体剂量预测与 SAR 幻灯片生成。
推荐理由:Inductive 公开其药化智能体 Indy 与 Claude、GPT 在数据质控和常规设计动作上的对照评测,可看判断力差距落在哪。
深势科技发布药物分子专利解析智能体PharmMaster·Patent,基于文档解析引擎Uni-Parser 1.4,可从专利PDF中提取分子结构并关联活性数据、实验条件与权利要求,每条结论保留来源页码可回溯原文。
推荐理由:该工具把专利中的分子结构、活性数据与权利要求关联成可核验记录,展示了跨页证据整理的具体做法。
Inductive Bio 随 OpenAI Rosalind Workbench 发布,将其 ADMET 模型接入 OpenAI 生态(含 ChatGPT、Codex 与 Rosalind Workbench);此前 6 月已作为 Claude Science 生态伙伴进入 Claude,本月早些时候通过 ModelHub 进入 Benchling。
推荐理由:Inductive Bio 的 ADMET 模型接入三家主流平台,展示了化学预测模型嵌入现有科研软件栈的分发路径。
Latent Labs 宣布药物设计智能体 Latent-Y 向全球研究者开放,获批研究者每天可免费获得 250 个设计。公司同时公布早期访问研究者的首批实验室结果,包括阻断离子通道的分子、在体内杀伤肿瘤细胞的 CAR-T 细胞,以及疟原虫难以通过突变逃逸的结合剂。
推荐理由:Latent Labs 开放其药物设计智能体 Latent-Y,并给出早期用户离子通道抑制剂与 CAR-T 的实验室结果。
Inductive Bio 宣布加入 Anthropic 生命科学生态,并发布 Model Context Protocol(MCP)连接器,让 Claude 和 Claude Science 用户可用自然语言对任意化学结构获取 ADMET 性质预测。
推荐理由:Inductive Bio 把其 ADMET 预测模型接入 Claude,为小分子设计中的性质评估提供了一种对话式调用入口。
Ginkgo Bioworks旗下Datapoints与Tangible Scientific、Inductive Bio联合推出高通量ADME平台ADME-One,将五项Tier 1 ADME检测、Inductive Bio的AI人体PK预测和化合物管理整合为一项服务。
推荐理由:三家合作方把高通量ADME实验、AI人体PK预测与化合物管理打包成一体化服务,展示AI与湿实验衔接的一种落地形态。