Syndirella:以合成导向的片段延伸把单个母核扩展出5085个候选分子
牛津大学 OPIG、Diamond Light Source 与 IBM Research 在 Chemical Science 发表 Syndirella,以合成导向的片段延伸(Synthesis Directed Elaborations)把可采购反应物按 SMIRKS 反应规则组合成候选分子。
推荐理由:文章拆解了以可采购反应物为导向的片段延伸流程,并给出合成成功率与姿态偏差的具体数据。
牛津大学 OPIG、Diamond Light Source 与 IBM Research 在 Chemical Science 发表 Syndirella,以合成导向的片段延伸(Synthesis Directed Elaborations)把可采购反应物按 SMIRKS 反应规则组合成候选分子。
推荐理由:文章拆解了以可采购反应物为导向的片段延伸流程,并给出合成成功率与姿态偏差的具体数据。
意大利帕维亚大学、Dana-Farber癌症研究院等团队在《Nature Biotechnology》发表开源平台AdaptiveFlow,将Enamine REAL Space约315亿原始分子预处理为约690亿可直接对接条目,通过18维分子性质分区与自适应靶标引导虚拟筛选(ATG-VS)降低超大规模对接开销。
推荐理由:研究用分子性质分区与靶标引导抽样压缩数百亿级对接空间,并在两个靶点获得实验验证的抑制剂。
侯廷军、康玉团队联合澳门理工大学刘焕香团队在Nature Protocols发布AI驱动的虚拟筛选平台CVSP-AIE,整合KarmaDock、CarsiDock与RTMScore重打分模型,通过分层调用平衡筛选速度与精度。
推荐理由:该平台把三种自研对接与打分模型整合为分层筛选流程,并给出在线与本地两种使用方式,便于比较速度与精度的取舍。
Ignota Labs与Broad Institute合作在《Journal of Chemical Information and Modelling》发表研究,提出先预测九项代理DILI标签、再与化学结构特征结合预测药物性肝损伤的DILIPredictor模型。
推荐理由:该研究把体外与体内代理指标并入特征,比较其对DILI预测的提升,并给出可复用的公开模型。