英灵殿科技等提出CODesign:让蛋白质序列与结构在全原子binder设计中保持一致
英灵殿科技联合香港中文大学、华盛顿大学等提出全原子蛋白质binder协同设计模型CODesign,通过一致性蒸馏构建约105,000对二聚体数据Codimer,并用多模态联合流匹配与一致性感知联合重采样(CAR)保持序列与结构一致。
推荐理由:作者团队提出以一致性为核心的蛋白binder协同设计方法,并用消融实验拆解数据与采样环节各自的贡献。
英灵殿科技联合香港中文大学、华盛顿大学等提出全原子蛋白质binder协同设计模型CODesign,通过一致性蒸馏构建约105,000对二聚体数据Codimer,并用多模态联合流匹配与一致性感知联合重采样(CAR)保持序列与结构一致。
推荐理由:作者团队提出以一致性为核心的蛋白binder协同设计方法,并用消融实验拆解数据与采样环节各自的贡献。
英灵殿科技团队提出 OFAntibody,一个以抗原结构、指定表位和预定义抗体框架或双抗构型为输入、生成 CDR 全原子结构的统一框架,支持纳米抗体单抗及 tandem VHH、diabody、CODV-like 等双抗构型的联合设计。
推荐理由:该研究把双抗两个结合臂与连接区放在同一全原子框架中联合生成,并给出与独立拼接的碰撞对比。
英灵殿科技团队提出 OFoldNA,将二级结构信息编码为已知配对、已知非配对和未知三种状态注入全原子扩散模型,统一支持核酸单体折叠与蛋白–核酸共折叠。
推荐理由:团队把二级结构编码进全原子扩散模型,并在 FoldBench 上与 AlphaFold 3 等基线逐项对比,可看核酸结构建模的评测细节。