Nature Communications 发表 StriMap:连接抗原呈递与TCR识别的结构信息深度学习框架
研究团队在 Nature Communications 发表 StriMap,将肽–HLA呈递与TCR–pHLA识别建模为前后关联的两阶段,融合氨基酸理化性质、ESM2表征和ESMFold预测结构经EGNN提取的空间信息。
推荐理由:该框架把肽–HLA呈递与TCR识别拆成两阶段建模,消融实验显示结构信息与TCR α链对识别预测有贡献。
研究团队在 Nature Communications 发表 StriMap,将肽–HLA呈递与TCR–pHLA识别建模为前后关联的两阶段,融合氨基酸理化性质、ESM2表征和ESMFold预测结构经EGNN提取的空间信息。
推荐理由:该框架把肽–HLA呈递与TCR识别拆成两阶段建模,消融实验显示结构信息与TCR α链对识别预测有贡献。
RyboDyn 在 bioRxiv 预印本中报告,其测序平台 RyboCypher 在肺癌、结直肠癌及癌旁组织和癌细胞系中解析出约660万个暗 RNA 位点,其中超过97%不见于现有非编码 RNA 数据库。
推荐理由:RyboDyn 用自建测序平台在肿瘤样本中挖掘出约8万条隐秘肽段,并给出一个可成药的表面靶点验证案例。
Roshan Rao 等在 bioRxiv 发布关于 ESMC、ESMFold2 和蛋白质机制可解释性的论文,并对上周初版做了修订。
推荐理由:作者说明 ESMC、ESMFold2 与蛋白机制可解释性预印本的修订内容,涉及基准评测与结果口径调整。