预印本探讨共折叠模型预测对齐误差的方向性如何用于多样分子复合物打分
作者在 X 上分享一篇 bioRxiv 预印本,讨论共折叠模型预测对齐误差(predicted aligned error)的方向性能为多样分子复合物的打分提供什么信息。原文未披露具体方法、数据集与评测结果。
作者在 X 上分享一篇 bioRxiv 预印本,讨论共折叠模型预测对齐误差(predicted aligned error)的方向性能为多样分子复合物的打分提供什么信息。原文未披露具体方法、数据集与评测结果。
牛津大学 Charlotte Deane 在 Nature Reviews Drug Discovery 访谈中介绍其联合领导的 OpenBind 计划,目标是建成全球最大的开放获取药物-蛋白质相互作用数据集,以改进蛋白-小分子结合结构与亲和力预测。
推荐理由:OpenBind负责人谈蛋白-小分子结合数据缺口,并给出首组数据集与盲测挑战的具体规模。
OpenBind联合OpenADMET与ASAP Discovery Consortium于2026年10月14日启动首届OpenBind盲测挑战,要求参赛者预测400个化合物与寨卡病毒NS2B-NS3蛋白酶形成的蛋白-配体复合物,化合物从小片段到类先导分子不等。
推荐理由:首届OpenBind盲测挑战以寨卡NS2B-NS3蛋白酶为靶点,用更严格的构象与物理有效性标准比较对接与共折叠方法。
Wankowicz与Bonomi在《Nature Methods》发表前瞻文章,指出AlphaFold等工具已改变静态结构预测,但仍无法捕捉完整构象集合,核心瓶颈是缺乏原子分辨率下可作金标准的真实参考数据。
推荐理由:文章系统梳理构象集合预测在数据、表示与评价上的瓶颈,为理解结构预测的下一步提供框架。