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  1. 奶牛猫的CADD实验室58

    ChemMedChem研究:Boltz-2结合姿势准确但亲和力排序在新口袋区域失效

    ChemMedChem发表研究,用43个15-PGDH抑制剂评估Boltz-2的亲和力预测能力。在结构修饰保守的两个系列中,Boltz-2的Spearman相关系数为0.68,接近FEP+的0.64;但在探索新结合口袋区域的Series 3中,部分化合物效价最高提升约500倍,Boltz-2却将整个系列预测为弱于母体化合物。

    推荐理由:该研究用43个15-PGDH抑制剂检验Boltz-2亲和力排序,显示姿势准确不等于排序可靠。

  1. Oxford Protein Informatics Group · Blog70

    OpenBind启动首届盲测挑战:预测寨卡NS2B-NS3蛋白酶与400个化合物的结合构象

    OpenBind联合OpenADMET与ASAP Discovery Consortium于2026年10月14日启动首届OpenBind盲测挑战,要求参赛者预测400个化合物与寨卡病毒NS2B-NS3蛋白酶形成的蛋白-配体复合物,化合物从小片段到类先导分子不等。

    推荐理由:首届OpenBind盲测挑战以寨卡NS2B-NS3蛋白酶为靶点,用更严格的构象与物理有效性标准比较对接与共折叠方法。

  1. DrugIntel74

    预印本追踪 Boltz-2 的 Pose→Affinity 信息流:亲和力头实际读取第二套结构

    Xeureka 的 Kazuya Ujihara 在 ChemRxiv 预印本中通过源码追踪和分层干预,分析开源 Boltz 2.2.1 的蛋白–配体亲和力推理通路,发现结构预测先决定 affinity crop,affinity pass 再对该 crop 重新扩散生成第二套结构,亲和力头读取的是这套结构而非用户看到的 written structure。

    推荐理由:源码追踪拆出 Boltz-2 亲和力预测的三条信息通路,为判断结构模型是否真正利用结合几何提供可迁移的审计方法。

已经到底了